终焉棱镜崩解后的宇宙重归多元，轮回之树根系延伸之处，无数新星系如雨后春笋般涌现。然而，在宇宙最古老的星域“原初之壤”，沉寂亿万年的混沌能量突然开始沸腾。暗红色的雾气从虚空中渗出，所过之处，空间结构如同融化的蜡像般扭曲变形，连光的传播路径都被强行弯折成诡异的螺旋。
莱娅的灵羽族先知们集体陷入深度昏迷，他们的梦境被同一种画面占据：巨大的黑色心脏在混沌深处跳动，每一次搏动都引发时空的剧烈震荡。当最后一位先知苏醒时，他的瞳孔中倒映出整个宇宙被混沌吞噬的景象，口中喃喃念着：“胎动已起，旧秩序的墓碑正在生长……”阿雷克斯的量子监测网络显示，原初之壤的混沌能量浓度正以指数级增长，预计三十个宇宙周期后将吞没半数星系。
苏尘与洛瑶的力量产生了前所未有的共鸣。苏尘的混沌之力不再受意识控制，在体表自发凝聚成狰狞的巨爪，所触之处物质瞬间坍缩成黑洞；洛瑶的星光则分裂成无数闪烁的暗星，这些暗星不断吸收周围能量，形成能吞噬光线的“光墓”。两人在冥想时，意识被强行拽入混沌核心，那里悬浮着一颗散发着腐臭气息的黑色胚胎，胚胎表面布满血管状的纹路，每条纹路都连接着一个正在衰亡的星系。
银河守望者联媚先遣舰队在原初之壤边缘全军覆没。幸存者的临终影像显示，战舰的金属外壳在接触混沌雾气后，竟逆向演化成最原始的氢元素。薇尔莉特带领的第二梯队装备了新型“秩序稳定舱”，试图在混沌中开辟安全区，却发现舱体的稳定立场反而加速了混沌能量的变异——雾气中开始浮现出扭曲的生物形态，它们没有固定结构，却能用声波震碎星舰的护盾。
莱娅通过灵羽族失传的“混沌共鸣”仪式，接触到了惊人真相。在宇宙诞生之前，存在着纯粹的混沌之海，十二工匠从混沌中抽取秩序之力创造万物时，将混沌的核心意识封印在原初之壤。经过无数次宇宙危机的冲击，封印逐渐松动，而终焉棱镜的崩解释放的能量，彻底唤醒了这颗“混沌之卵”。它的苏醒，意味着宇宙将回归最原始的无序状态。
阿雷克斯带领科研团队提出“熵逆工程”，试图用机械联邦的顶尖科技将混沌能量逆向转化为有序物质。他们建造了环绕整个星域的巨型粒子对撞机，发射出携带文明规则的“秩序光束”。但光束在接触混沌雾气的瞬间，竟被转化为加速混沌胎动的催化剂。灵羽族祭司们发动“万灵镇魂曲”，用古老歌谣安抚混沌意识，却只换来更剧烈的震动，无数古老星球在声波中化为齑粉。
苏尘与洛瑶在混沌核心与混沌意识展开对决。混沌意识化作无数个苏尘与洛瑶的扭曲镜像，它们用低沉的声音嘲讽：“你们本就是从混沌中诞生，为何要抗拒回归？”战斗中，两人逐渐意识到，混沌并非纯粹的毁灭——在无序的表象下，蕴藏着孕育新生的可能。当他们停止攻击，将混沌之力与星光之力化作滋养的能量注入混沌之卵时，卵壳表面竟浮现出全宇宙文明的图腾。
在全宇宙文明的信念加持下，混沌之卵停止了破坏性的胎动，缓缓裂开缝隙。从中诞生的不是毁灭者，而是一株晶莹剔透的“混沌新芽”。新芽的每片叶子都呈现出不同的物理法则，它的根系扎根混沌，枝叶却绽放着秩序的光芒。轮回之树的根系主动延伸与新芽相连，两者融合成全新的“创生之树”。战后，原初之壤成为宇宙的“新生摇篮”，苏尘与洛瑶的力量则化作创生之树的守护灵，见证着旧秩序的消亡与新文明的永恒胎动。
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